J. Pažout, K. Portmann, Na rozcestí. Alternativy vývoje českých, slovenských a československých dějin v druhé polovině 19. století a ve 20. století, 2023
J. Pažout, T. Vilímek, Pohyblivé hranice diktatury ve světle stížností a anonymů československých občanů (1948–1989), Praha, Ústav pro soudobé dějiny AV ČR,v.v.i., 1, ISBN: 978-80-7285-288-8, 560 pages, 2023
J. Pažout, I. Vachková, Česko-slovenské dějiny ve výuce, 2022
J. Pažout, M. Václavíková, Z. Kokošková, Die Oberlandratsämter im System der Besatzungsverwaltung des Protektorats Böhmen und Mähren und ihre leitenden Beamten, Marburg, Verlag Herder Institut, 1, ISBN: 978-3-87969-473-0, 318 pages, 2022
J. Pažout, K. Portmann, Místa paměti na druhou světovou válku a jejich proměna, 2022
J. Pažout, Pod dohledem VLKa. Výbor lidové kontroly SSR a agenda stížností, oznámení a podnětů občanů (1971–1990), Soudobé dějiny, Praha, Ústav pro soudobé dějiny AV ČR, v.v.i., p. 90-129, 40 pages, ISSN: 1210-7050, n. 1, [Online], 2022
J. Rychlík, J. Pažout, K. Portmann, B. Frommer, J. Bárta, P. Bednařík, Z. Hanák, Z. Hrubešová, E. Janečková, N. Kmeť, V. Kyncl, J. Myroniuk, K. Nowak, Š. Šutaj, P. Kmoch, Spravedlnost, nebo pomsta? Potrestání válečných zločinců, kolaborantů a zrádců po 2. světové válce v Československu, Liberec - Praha, Technická univerzita v Liberci - Ústav pro studium totalitních režimů, 1, ISBN: 978-80-7494-603-5, 364 pages, 2022
J. Pažout, M. Ulvr, J. Rychlík, J. Bárta, P. Bednařík, T. Bursík, N. Kmeť, J. Kratochvíl, P. Tomek, I. Vachková, T. Vilímek, Ze studnice informací. Příspěvek k problematice stížností v komunistickém Československu, Praha - Liberec, Ústav pro studium totalitních režimů - Technická univerzita v Liberci, 1, ISBN: 978-80-7494-649-3, 338 pages, [Online], 2022
J. Pažout, T. Vilímek, Barometr nálad, studnice informací. Dopisy občanů vedoucím představitelům a orgánům Komunistické strany Československa v letech 1988–1989, Praha, Ústav pro soudobé dějiny AV ČR, v.v.i., ISBN: 978-80-7285-255-0, p. Praha, 518 pages, 2020
J. Pažout, T. Vilímek, J. Kocian, S. Balík, J. Hloušek, Dějiny Komunistické strany Československa IV. 1969-1993, Praha, Academia, 1, ISBN: 978-80-200-3174-7, 591 pages, [Online], 2020
J. Pažout, Neklid před bouří. Členská základna Komunistické strany Československa na sklonku normalizace, Soudobé dějiny, Praha, Ústav pro soudobé dějiny AV ČR, v.v.i., p. 477-524, 48 pages, ISSN: 1210-7050, n. 3-4, [Online], 2020
J. Pažout, Spravedlnost, nikoli pomsta? Potrestání válečných zločinců, kolaborantů a zrádců po 2. světové válce v Československu a Polsku, 2020
J. Pažout, K. Portmann, R. Kvaček, J. Rychlík, „Nechtění“ spoluobčané. Skupiny obyvatel perzekvovaných či marginalizovaných z politických, národnostních, náboženských i jiných důvodů v letech 1945–1989, Liberec - Praha, ÚSTR - TUL, ISBN: 978-80-7494-421-5, 256 pages, [Online], 2019
J. Pažout, K. Portmann, R. Kvaček, J. Rychlík, M. Michela, P. Mičko, I. Baka, J. Bárta, P. Bednařík, M. Fiamová, D. Hubený, M. Sedláková, Š. Jarská, S. Kokoška, J. Kratochvíl, V. Mohn, J. Němeček, J. Rákosník, M. Sabol, M. Syrný, I. Vachková, Ve stínu války. Protektorát Čechy a Morava, Slovenská republika, Říšská župa Sudety a další odtržená československá území v letech 1938/39-1945, Praha - Liberec, Ústav pro studium totalitních režimů - Technická univerzita v Liberci, 1, ISBN: 978-80-7494-500-7, 468 pages, 2019
J. Pažout, Vnitřní podoba Komunistické strany Československa v období tzv. normalizace – pokus o základní charakteristiku, Paginae historiae. Sborník Národního archivu, Praha, Národní archiv, p. 723-735, 13 pages, ISSN: 1211-9768, n. 1, [Online], 2019
J. Pažout, J. Rychlík, R. Kvaček, M. Melanová, M. Ducháček, H. Demattio, D. Hubený, P. Jakubec, V. Kaiser, P. Karlíček, V. Kessler, j. Kouřinský, E. Mikušek, M. Petrus, K. Řeháček, D. Šmajstrlová, Vznik Československa a provincie Deutschböhmen, Praha - Liberec - Litoměřice, Scriptorium - Technická univerzita v Liberci - Státní oblastní archiv v Litoměřicích, 1, ISBN: 978-80-7494-472-7, p. Praha - Liberec - Litoměřice, 288 pages, [Online], 2019
J. Pažout, Programmnyje položenija antirežimnoj oppoziciji v Čechoslovakiji na pervom etape „režima normalizaciji“ (1969-1972 gg.), Inakomyslije v uslovijach „realnogo socializma“. Kontury novoj gosudarstvennosti. Konec 60-ych – 80 gg. XX. v., Moskva, Institut slavjanovedenija RAN, ISBN: 978-5-7576-0318-6, p. 323-345, 23 pages, 2017
J. Pažout, Trestněprávní perzekuce odpůrců režimu v Československu v období takzvané normalizace (1969-1989), Praha, Ústav pro soudobé dějiny AV ČR, v.v.i., 1, ISBN: 978-80-7285-205-5, 603 pages, 2017
J. Pažout, Ochrana společnosti nebo vnitřní vyhnanství? Zákon o ochranném dohledu č. 44/1973 Sb. z 25. dubna 1973 a jeho využití proti odpůrcům režimu, Paginae historiae. Sborník Národního archivu, Praha, Národní archiv, 1, p. 229-272, 44 pages, ISSN: 1211-9768, n. 24/2, 2016
J. Pažout, Vysokoškolské studentstvo jako nositel nonkonformity a proreformních aktivit v československé společnosti 60. let 20. století, Príliš ľudská tvár socializmu? Reforma zdola a okolnosti reformného procesu v Československu 1968, Bratislava, Sociologický ústav SAV, 1, ISBN: 978-80-85544-97-8, p. 368-391, 24 pages, 2016